O museu surge no âmbito da conclusão das obras de remodelação da Casa da Prelada, que teve início no verão de 2011, e irá permitir instalar os serviços de biblioteca, arquivo e provedoria no edifício restaurado.

Além destes serviços, o museu vai acolher o património artístico da Santa Casa, que conta com milhares de peças de pintura, escultura, ourivesaria e paramentaria. Estas peças estão a “ser restauradas” pelo Centro de Conservação e Restauro da Escola das Artes da Universidade Católica Portuguesa, assegurou à agência Lusa Américo Aguiar, responsável pelo departamento de atividades culturais da Santa Casa da Misericórdia do Porto.

O museu irá ocupar um edifício na rua das Flores.